Яков Яковлевич Шнейдер родился в семье доктора юриспруденции Якова Ивановича Шнейдера.
Служил в лейб-Гренадерском полку.
30.01.1806 г. переведён в лейб-гвардии Преображенский полк штабс-капитаном из капитанов лейб-Гренадерского полка, с оставлением санкт-петербургским плац-адъютантом.
По состоянию на 1810-1812 гг. полковник, при санкт-петербургском военном губернаторе.
Участник Отечественной войны 1812 г. (Бородинское сражение) и Заграничного похода 1813-1814 гг.
Награждён орденом св. Владимира 4-й ст., золотой шпагой "За храбрость". На Бородинское сражение награждён орденом св. Анны 2-й ст.:
26 августа находясь при Главнокомандующем армиями исполнял разные препоручения в самых опасных местах с неустрашимостью и совершенным успехом.
10.10.1813 г. уволен в чине полковника по болезни к статским делам, статским советником.
Жена - Александра Петровна Шнейдер (?).
Скончался в 1840 г. Похоронен на Волковом лютеранском кладбище Санкт-Петербурга.